Álex Márquez végzett az élen a Japán Nagydíj edzésén a MotoGP-ben Pedro Acosta és Marc Márquez előtt. A gyári Aprilia pilótái szintén továbbjutottak, ellentétben Ai Ogurával, akinek a tréning elején elfüstölt a motorja.
Magyar idő szerint péntek reggel rendezték a MotoGP Japán nagydíjának edzését. Szokás szerint ekkor dőlt el, hogy melyik tíz versenyzőnek nem kell részt vennie a szombati időmérő első szakaszában, ám mindez már az első gyakorlás során megsérült, szabadkártyásként induló Takaaki Nakagami nélkül zajlott. A levegő hőmérséklete 23, az aszfalté 35 fok volt a kezdés pillanatában.
A tréning lénygében egy bukással kezdődött, Álex Rins a 3-as kanyarban bukott a kivezető körén. Ami a köridőket illeti, Marco Bezzecchi 1:45.223 másodperccel kezdett a legjobban a lágy hátsó abronccsal, 481 ezreddel megelőzve Pedro Acostát. Utóbbi aztán 1:44.924-re javított, de Luca Marini 83, míg Jorge Martín 8 ezreddel bizonyult gyorsabbnak nála.
Utóbbi aztán az 1-esben elesett, miközben Acosta 444 ezredet, míg Bezzecchi 41 századot adott neki. A következő áldozat Ai Ogura volt, ám ő nem került a földre, hanem a motorja a célegyenesben elkezdett füstölni, ezért kénytelen volt félrehúzódni. Azonban hiába tette ezt meg a lehető legkorábban, piros zászlóval megszakították a körözést.
Az újraindítás után tovább érkeztek a javítások: Acosta 11 ezreddel javult, és Álex Márquez, valamint Johann Zarco is megérkezett az élmezőnybe. Sőt, előbbi 1:44.382-vel átvette a vezetést, de csak pár másodperc erejéig, ugyanis honfitársa 514 ezreddel gyorsabb volt nála. Azonban ő sem vezetett sokáig, hiszen Bezzecchi 124 ezreddel felülmúlta az idejét, míg Marc Márquez 221 ezredes lemaradással feljött a harmadik pozícióba. A gyári KTM motorosa aztán tovább javított, de csak csökkenteni tudta hátrányát, egészen pontosan 16 ezredre.
Egy ideig aztán nm változott az élmezőny sorrendje, majd félidő környékén Marc Márquez 119 ezredes előnnyel átvette a vezetést a közepes hátsón. Martín 32 ezredre megközelítette őt a lágyon, míg Bezzecchi a harmadik szektorig jól állt, ám aztán nem jött össze neki a javítás. Acosta ellenben javított, és 34 ezreddel megelőzte leendő csapattársát.
Bő negyed órával a leintés előtt Fermín Aldeguer kezdte meg a hajrát, miután mindössze 3 ezreddel átvette a vezetést. Ezt követően jött Bezzecchi, aki 1:43.276-tal állt vissza az élre, de Marc Márquez 138 ezreddel nála is gyorsabb volt. Az olasz pilótának azonban volt válasza, és 109 ezreddel felülmúlta a gyári Ducati versenyzőjét, miközben Acosta 141 ezredes lemaradással feljött a harmadik helyre, míg mögötte Álex Márquez és a két LCR volt a sorrend. Acosta ezután tovább faragta a lemaradását, és 64 ezredes hátránnyal feljött a második pozícióba, míg Martín ötödikként várta az utolsó etapot.
Miután a pilóták visszatértek a pályára, elsőre senki nem javított az élmezőnyből, majd Zarcónak a 14-es kanyarban történt bukása borzolta a kedélyeket. Ezt követően Álex Márquez 1:42.811-gyel átvette a vezetést, 76 ezreddel felülmúlva Acostát, és 1 tizeddel testvérét. Eközben az 5-ösben az LCR másik pilótája, Diogo Moreira is a kavicságyban kötött ki, igaz, ő nem esett el.
Innentől kezdve nem változott az első három sorrendje, ahogyan Bezzecchi is maradt a negyedik. Mögötte Enea Bastianini, Fabio Di Giannantonio, Fabio Quartararo, Martín, Moreira és Zarco lett az első tíz sorrendje. Ogura a tizenharmadik, míg Francesco Bagnaia a tizenhatodik helyet szerezte meg.