Zsinórban második rajtelsőségét szerezte a bajnoki listavezető Jorge Martín, miután a Japán Nagydíj időmérőjén is ő lett a leggyorsabb. A hajrában hibázó Marc Márquez második, a friss futamgyőztes Pedro Acosta harmadik helyen zárt.
A szombati program persze a hétvége utolsó szabadedzésével indult a MotoGP számára, ahol Marco Bezzecchi jegyezte a legjobb időt Martín és Acosta előtt, de a tempó elmaradt a péntekitől. A közvetlenül ezután startoló időmérő aztán a Q1-gyel nyitott, ahol a pénteki edzés eredménye alapján mindkét Trackhouse Apriliának jelenése volt, ám ők is számítottak a fő favoritnak a továbbjutásra. Ezt bizonyítva Ai Ogura már első gyorskörében olyan időt jegyzett, ami egy nappal korábban kényelmesen automatikus Q2-es részvételt ért volna. Ezt aztán 1:42,8-ra javította, amivel már a pénteki legjobb köridőhöz is közel került.
Erős tempót motorozott Raúl Fernández is, ám Francesco Bagnaia a Ducatival az utolsó percekre fordulva befurakodott a második helyre a két Aprilia közé. Fernández erre legjobb első szektorral válaszolt, de a Brad Binder bukása miatt lengetett sárga zászló okán nem tudta a körét hasonló tempóban befejezni.
📈 @peccobagnaia gets to P2 @BradBinder_33 crashes and the yellow flags catch @25raulfernandez 👀#JapaneseGP 🇯🇵
Maradt azonban még idő egy utolsó menetre a Q2-es helyek elcsípéséhez, ekkor pedig Fernándeznek már összejött egy tiszta kör, és Ogura mögött egyetlen ezreddel zárva a két Trackhouse Aprilia végül biztosította is a továbbjutást. Az előző két évben a Japán Nagydíjat megnyerő Bagnaia így harmadik lett, vagyis a hétvégi rajtrácsokra a 13. helyen ragadt.
Negyedikként zárt a Q1-ben Franco Morbidelli, míg remek teljesítménnyel ötödik lett a thai Somkiat Chantra, aki Joan Mir helyetteseként beugorva legyőzte csapattársát, a közvetlenül mögötte végző Luca Marinit.
12 versenyző részvételével következett a negyedórás Q2, amelyben az első gyorskörök után Marc Márquez állt az élre, majd nem sokkal utána 1:42,4-gyel tovább erősítette pozícióját, jelentősen faragva a pénteken felállított pályacsúcson is. Testvére, Álex Márquez jött be egy időre a második helyre, ám a pontversenyt vezető Jorge Martín csak ezt követően húzta elő, ami a tarsolyában lapult: az Aprilia spanyol versenyzője 1:42,371-es kört repesztett, amivel az élre állt.
Ekkor még bőven volt idő hátra, Marc Márquez pedig több kísérletet is tett arra, hogy visszaálljon az élre, de már nem tudott javítani: egyik alkalommal le is csúszott a kavicságyba a 3-as kanyarban.
A kilencszeres bajnok korábbi ideje így is elég volt ahhoz, hogy megtartsa a második helyét 110 ezredmásodperces lemaradással Martín mögött. Az utolsó gyorskörök során a friss futamgyőztes Pedro Acosta jött be a harmadik helyre, ezzel véglegesítve az első rajtsort, míg a másodikban Marco Bezzecchi, Álex Márquez és Fabio Di Giannantonio zárt. A rajtrács első négy helyén ugyanabban a sorrendben állnak majd fel a versenyzők, mint két hete az Osztrák Nagydíjon.
A 7. és a 12. között sorrendben Enea Bastianini, Fernández, Diogo Moreira, Johann Zarco, Ogura és Fabio Quartararo töltötték fel a helyeket, vagyis a két Trackhouse Aprilia az élmezőny csatájába már nem tudott beleszólni.
Martín mindeközben Assen és Spielberg után szezonbeli harmadik rajtelsőségét szerezte, ami az Apriliával a 3., összességében pedig már a 24. lett számára a MotoGP-ben. A bajnokságot Marc Márquez előtt 12 pontos előnnyel vezető 2024-es világbajnok ennek értelmében tehát a ma, szombaton 8 órakor kezdődő sprintet, valamint a vasárnap reggel 7 órakor startoló főversenyt is a mezőny éléről kezdheti meg.
Az időmérő végeredménye:

